松果体的感光性也能为说明我们的心情好坏与天气情况有很大关系。阳光明媚、天气晴朗，我们感觉到心情舒畅，而乌云密布、烟雨绵绵，我们感觉郁郁寡欢。这是因为松果体分泌出的褪黑激素，能控制体内各种分泌腺的活动，并且会受到光照的影响，所以当强光照射时，褪黑激素的分泌就会减少，人的心情则会变好；而在暗光下，褪黑激素分泌就会增加，心情则会变得压抑。

 　同样，由于松果体分泌的褪黑激素受到的光敏感性，松果体发挥着人体“生物钟”的调控作用。受褪黑激素的分泌受光照和黑暗的影响，因此，昼夜周期中光照与黑暗的周期性交替，就会引起褪黑激素的分泌量相应地出现昼夜周期性变化。每当白昼时，褪黑激素在血浆中的浓度就会降低，反之，夜晚就会升高。松果体通过褪黑激素的这种昼夜分泌周期，向中枢神经系统发放时间信号，转而引发若干与时间或年龄有关的“生物钟”现象。如人类的睡眠与觉醒、月经周期中的排卵以及青春期的到来。新近发现，人体的智力“生物钟”以33为周期进行运转，情绪“生物钟”为28天，体力“生物钟”为23天。这三大生物钟的调拨也是由松果体来执行的。

  并且，松果体在人体内执行着一个神经——激素转换器的功能。松果体分泌的褪黑激素能够影响和干预人类的许多神经活动。松果体的主要激素为褪黑素，属于吲哚类化合物，其分泌呈现明显的日周期变化。两栖类动物褪黑素对其有促使皮肤褪色的作用。对哺乳类已经失去这种作用，褪黑素的生理作用可能通过下丘脑、或直接抑制垂体促性腺激素的分泌，抑制性腺活动，抑制性成熟，防止儿童早熟。在1909年一位德国的医师发现一位4岁的男孩提早经历了不成熟的青春期，然后死亡。验尸结果发现这个男孩死于松果体的恶性肿瘤。因此这位医师便假设正常的松果体能在孩童时期产生抑制性发育的荷尔蒙，假使腺体被肿瘤所破坏，抑制的作用便会停止，使得性发育提早发生。

  那么摘除松果体对哺乳动物会有什么影响呢？有科学实验结果显示,摘除大鼠松果体，可以引起大鼠学习记忆能力减退，运动皮质、体感皮质及海马 AChE 纤维密度减低，原因尚不清楚, 可能与以下因素有关：正常大鼠褪黑激素分泌呈周期性 ，早上4时开始分泌，中午 12 时达最高峰，然后逐渐降低，至晚 7 ～ 8 时降为零，它与大鼠昼伏夜动时性相一致。摘除大鼠松果体，导致大鼠血中褪黑激素浓度大幅度降低，昼夜分泌节律消失，环境光照周期信号不能转变为大鼠机体内源性昼夜节律信号，使机体固有内源性节律紊乱，从而影响睡眠-觉醒周期。研究发现,，摘除大鼠松果体后，大鼠 睡眠时间紊乱、睡眠障碍、易觉醒、精神呆滞。这些可能是造成大鼠学习记忆障碍的原因之一，至于睡眠障碍是否可以造成胆碱能神经损害还尚未报道。而意大利的一项最新研究表明，正常的松果体可能还有防癌作用。因为发现切除松果体后能促进某些肿瘤的生长。